仍是台行政院生技产业策略咨议委员、台生技医疗产业策会会长，牢牢掌握台湾生科技政策的方向盘，也正是他和陈良博、李远哲邀请蔡英文任宇昌科技首任董事长。同时，翁启惠在民国105年2016年还卷曾经与其主的中研院有密切合作关系和资金往来的生科技公司浩鼎生技的案件中，翁借用其nV儿和另一GU东的名义，大肆购买浩鼎的GU票，经法院裁定金额达1亿6000余万元新台币，而且这笔钱他号称是从富豪尹衍梁那里借来的。在宇昌生技民国96年2007年成立的关键时刻给予援手的还有时任台湾「国科会」主委陈建仁，也就是民国105年2016年蔡英文首夺「总统」大位时的「副总统」搭档。

蔡英文侄蔡元立民国97年2008年初控告蔡瀛南返房屋。民国80年1991年6月，蔡洁生的三房长蔡瀛任过世，蔡洁生决定将蔡瀛任名下资产，由蔡瀛任刚成年的长蔡元立继承，但印鉴、权状等仍由自己保，不料此举竟成为他过後孙争产的引爆。民国95年2006年7月，蔡洁生过後，蔡元立陆续发动诉讼。民国97年2008年初先控告二房大伯蔡瀛南，要求返还台北市民族东路一间房屋，他称该屋是他继承而得，却遭以买卖为由移转到大伯名下。蔡瀛南则称，侄蔡元立先前在国外读书、生活等费用，都是蔡洁生支付，父亲为此曾向他借款约530万元，後来把该屋移转给他作为补偿，一审判蔡元立败诉，但二审认为，蔡瀛南无法证明蔡元立曾授权蔡洁生帮忙理名下房屋，改判蔡瀛南须还屋定谳，最终争回房屋。

然而，事实并不如蔡英文所说「相安无事」。

民国99年2010年，蔡元立改打民事诉讼，指张柏年取得前述土地後，民国97年2008年间再把地卖给宏盛建设GU份有限公司，售价3.8亿元，故无法返还土地，要求张柏年返还前述易、扣除税金後

之所以说低调，在於外界对蔡英文家族成员知之甚少。不只投资有，蔡洁生情史也相当丰富。外界仅知蔡洁生的偶栏一直是空白，但其4个「nV朋友」为其生了11个小孩。蔡英文家族亲戚众多，但每一位都异常「安静」，「低调到不能再低调」，从不接受采访。堂蔡薰慧、侄蔡元仕，在纷的司法界「大隐隐於市」。蔡英文家族那麽有钱，发迹史始终是个谜。对於如何发财致富，蔡家也一直是三缄其，多是以老八GU的方式予以回应，即：早年通过改修汽车得第一桶金、後参与买卖土地致富等等。台湾社会不断要求蔡英文公布家相关资讯，但蔡却一直以个人yingsi为由加以拒绝。台湾「第一家族」的秘密，蔡英文不说，蔡家人不谈，可能没有人会知，因此蔡英文家族被认为是「谜一样」的家。

《商业周刊》报导称，蔡英文也曾私下跟朋友自嘲，说父亲很厉害，对每个nV友都很公平，因此各家相安无事，情都十分好。b如她的衣服几乎都是买的，看到合适的衣服，就会帮妈妈和她也各买一件。

蔡洁生过时，偶栏仍空白，後留下的庞大遗产。民国105年2016年3月中旬，台湾媒T刊蔡英文家族三桩争产官司，蔡英文的父亲、蔡英文的四位「母亲」、蔡英文的11位兄才得以一一曝光，蔡英文是11个nV中最小的。好友洪清隆曾问过蔡洁生，会不会担心将来小孩争产？蔡回答说，他依序登记给小孩们，人人有份。

同年，蔡元立又提请一桩诉讼，诉张柏年返还不当得利。民国83年1994年，蔡洁生生前将登记在蔡瀛任名下的内湖一笔土地，卖给继张柏年。张柏年是蔡英文母亲张金凤与日本前夫的儿，与蔡英文同母异父。民国97年2008年5月，蔡瀛任的儿蔡元立控告张柏年，指自己应继承父亲一笔台北市内湖区土地，约159坪，民国80年1991年父亲蔡瀛任过，土地应由其单独继承，但该笔土地民国83年1994年未经自己同意，就被祖父卖给张柏年。蔡元立举证易双方未约定买卖价金，负责这起买卖易的代书陈幸助已证实蔡洁生和张柏年并未实际签订买卖契约、也未约定定价金额，张柏年也始终未能合理说明本次买卖价金如何支付等细节。蔡元立主张买卖不成立，张柏年应依不当得利返还土地。张柏年取得土地的过程涉伪造文书，但此分因逾追诉期不起诉。